Dokážeme rychleji identifikovat ohnisko nákazy. Hygienici mají zbraň na epidemii od libereckých vědců

Práce hygieniků v době epidemie spočívá v shromaždování co nejpřesnějších informací o nakaženém. „Jsou to informace o osobě, místě a času. Přesná práce s touto trojicí informací nám umožňuje mnohem lépe a rychleji identifikovat ohnisko nákazy, což je pro nás hygieniky zásadní,“ říká Vladimír Valenta, ředitel krajské hygieny.

A právě tyto informace shromažďuje systém vyvinutý na univerzitě v Liberci. Jmenuje se EpiGIS a vědci na něm pracují už od roku 2019. Koronavirus pak vývoj zásadně urychlil.

Z týdnů na testování byly dny

„Museli jsme jednat rychle. V řádech dnů jsme pozměnili priority a harmonogram výzkumného záměru a vše směřovali k tomu, abychom mohli epidemiologům nabídnout funkční nástroj, který je nezaměstná na dlouhé týdny při zaškolování, ale který jim okamžitě pomůže v jejich práci,“ vysvětluje vedoucí vývojového týmu Jiří Šmída z katedry aplikované matematiky Fakulty přírodovědně-humanitní a pedagogické.

Na aplikaci pracují odborníci také z dalších fakult, epidemiologové i externí programátoři z firmy Coffee Workers. Podle Šmídy měl EpiGIS sloužit přesně pro případy, jako je epidemie koronaviru. Testování systému se ale smrsklo místo týdnů na dny a celý systém dále jeho tým ladil za pochodu. „Výstupní data jsou ale spolehlivá, za těmi si stojíme,“ dodává.

Na podobě celého systému se nadále pracuje, výzkumný tým čeká ještě hodně práce. Už nyní o něj ale projevily zájem i hygienici v dalších krajích Česka. „Čeká nás ještě mnohaměsíční vývoj všech jeho částí, které dají epidemiologům a hygienikům do rukou nástroj pro moderní práci za jakékoliv epidemie, nejen té aktuální a nejvíce viditelné,“ myslí si Šmída.

Analýza i negativně testovaných

Základem systému jsou geografické informační systémy. Po zadání dat pak lze vygenerovat grafy a mapové podklady. „Epidemiologové musí řešit desítky dalších epidemií, které v průběhu roku přichází. A potřebují data o osobách, místě a čase rychle a přesně sbírat, prohlížet v mapách a analyzovat. A také komunikovat s veřejností: se starosty obcí, novináři, občany. Na to vše se náš projekt soustředí,“ vysvětluje s tím, že velkou výhodou je fakt, že systém analyzuje i negativně testované osoby.

Liberečtí hygienici tak mají výhodu v tom, že díky EpiGISu mají zanalyzované všechny případy v souvislosti s koronavirem od začátku března. „A to jak těch testovaných s pozitivním, ale i negativním výsledkem, tak také těch ostatních, u kterých byla po návratu z ciziny nařízena povinná domácí karanténa,“ doplňuje Jana Prattingerová, ředitelka odboru protiepidemického krajské hygieny.